PubMed

搜寻引擎

PubMed 是一个提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要,并且免费搜寻的数据库。它的数据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学,但亦包括其他与医学相关的领域,像是护理学或者其他健康学科。

简介
PubMed是一个免费的MEDLINE数据库,提供生物医学和健康科学领域的文献搜索服务。MEDLINE是当今世界上最权威的文摘类医学文献数据库之一,1996年起向公众开放。而PubMed是互联网上使用最广泛的免费MEDLINE检索工具,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的一个基于WEB的生物医学信息检索系统,也是NCBI Entrez数据库查询系统中的一个。PubMed数据库包含超过3200万篇生物医学文献和摘要。不提供期刊文章的全文,但是通常会附有指向全文的链接。PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供原文获取服务免费提供题录和文摘,可与提供原文的网址链接,提供检索词自动转换匹配,操作简便、快捷。。
数据库
PubMed的数据主要来源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied bypublisher等。数据类型:期刊、综述、以及与其它数据库链接。与MEDLINE数据库相比,PubMed具有收录范围更广、界面更友好、文献报道速度快等优点。
MEDLINE收录1966年以来的包含医学、护理、兽医、健康保健系统及前临床科学的文献1600万余条书目数据(2005年数据),记录的标记为[PubMed-indexed for MEDLINE]。这些数据来源于70多个国家和地区的4800多种生物医学期刊,近年数据涉及30多个语种,回溯至1966年的数据涉及40多个语种,90%左右为英文文献,70%~80%的文献有著者撰写的英文摘要。
In Process Citations:1996年8月开始,每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为[PubMed-in process]。当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时,每星期转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。
OLDMEDLINE:含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要,记录的标记为:[PubMed-OLDMEDLINEfor Pre1966]。
Publisher-SuppliedCitations (Articles Not in MEDLINE or IN Process):是由出版商提供的电子文献,每条记录标有[PubMed – as supplied by publisher]。这些文献包括两种来源: MEDLINE收录范围的文献,每日被添加到InProcess Citation中去,换上[PubMed – in process]的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID而没有MEDLINE UI。
服务项目
检索方法
PubMed的检索方式有基本检索、高级检索、主题词检索、期刊检索、临床查询、单篇引文匹配等,最核心的检索技术是自动语词匹配。
1、布尔逻辑检索
语句:AND OR NOT
直接输入多个单词,默认空格为AND,如diabetes HbA1c
复杂运算则AND不能省略(HbA1c OR IGT)AND diabetes
运算符大小不忌,默认顺序从左到右,可用括号改变顺序diabetes and(HbA1c OR IGT)
2、字段限定
1)正确格式:检索词[字段名]
如diabetes[TI]
2)[AU]著者检索构词规则:姓全称在前,名首字母在后
如张三——ZhangS
3)2002年后录入作者全名,字段名为[FAU]
Steven R Smith[FAU]
4)短语检索
“”精确检索,不改变顺序与位置。完全按“”内的内容检索
5)截词检索
*多放单词后方,如retrie*包含retrie在内的所有单词,如retrieve、retrieval
6)自动语词匹配:
系统对输入的检索词,会进行自动语词匹配处理,努力实现检索词的最大语义转换,转换结果会在detail中显示
转换遵循以下三个规则
1)对于输入检索框的检索词,系统首先在多个转换表(MeSH主题词、刊名、作者转换表)中进行搜索比对,并自动转换为相应的主题词、著者、刊名。如输入new england journal of medicine,将自动转换为”N Engl JMed”[Journal];输入vitamin h,将自动转换为”biotin”[MeSH Terms]
2)再将检索词在全部字段(all fields)中进行检索,并执行OR布尔逻辑运算。如输入vitamin h,将自动转换为”biotin”[MeSH Terms]OR ”biotin” [All Fields] OR “vitamin h” [All Fields]
3)若输入多个检索词或短语词组,系统会继续将其拆分为单词后按照1和2分别进行检索,单词之间布尔逻辑运算为AND。输入single cell,将自动转换为(”single person”[MeSH Terms] OR “single”[All Fields] OR “person” [All Fields] OR “single person” [All Fields] OR“single” [All Fields]) AND (“cells”[MeSH Terms] OR ”cells” [All Fields] OR“cells” [All Fields] OR “cell” [All Fields])
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物 学数据,序列中心的数据等等。PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
检索注意事项:
检索汉化
汉化,让中国的PubMed使用者尽量多的看到、使用自己更为熟悉的、美丽的中文。高级检索页面进行了汉化。检索关键词进行了汉化提示。网络词典集成检索结果页面集成了根据北京金叶天盛科技有限公司著名产品《新编全医药学大词典
特点
第三方PubMed
GoPubmed
GoPubMed是德国2006年创建2008年成熟推出对PubMed进行语义智能检索、分类导航和深度开发的体现崭新思维的网络检索工具,也是一种对检索结果进行多维统计分析的软件.通过它用户可以节省90%以上的网上搜索时间.检索者可以很快了解检索到文献的概貌和该研究领域的研究态势,如论文作者的研究轨迹、论文的年度分布、全球核心作者及核心期刊、合著者可视化关系网络图以及作者分布世界地图等等.
PubMed-cn
PubMed-cn为丁香园旗下网站,专业的医学文献数据库,其数据每天与美国的NCBI数据中心同步一次。用户在检索文献时,可以立即看到该文献影响因子;用户可以在期刊数据库查询影响因子变化趋势、投稿指南、投稿经验等相关的信息。并且PubMed-cn提供国家自然科学基金查询,分析各个地区中标率,热门学科,是申请NSFC的好帮手。
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