会津藩的领地最初长时间属于芦名氏统领，传了十几代家督。1384年的时候芦名直盛建东黑川馆，这个也就是会津藩的鹤ケ城的前身。战国时期的芦名盛氏将其改筑为黑川城，战国末期芦名家内部家臣多次出现动荡局面，1589年，芦名义广的一万六千军与伊达政宗的二万三千人在摺上原展开激战，最后导致了芦名家的灭亡，伊达政宗从此领有此地。
变迁
秀吉的
小田原讨伐战，伊达政宗在几经考虑后最后加入了丰臣方，但是在战后秀吉以迟到为由，将伊达转封至米泽，而把
会津、白河、石川、岩瀬、安达总共四十二万石的领地给了浦
生氏乡。在平定了
一揆以及
九户政实的反乱之后，氏乡的领地增加到了九十一万九千余石。后来氏乡病死，其长子秀行继任家督，但是没有多久就被转封到宇都宫，上杉景胜以一百二十万石大封，转封会津。关原合战后，上杉家被减封，迁移到米泽。而秀行再度回到会津，领有六十万石。秀行病死后长子忠乡继任，忠乡病死后，因为无嗣，领地被幕府没收了，曾经是践岳七本枪之一的
加藤嘉明成为后继者。1631年，加藤嘉明亡故，长子明成继任，后因为家中出现骚动，因此领地奉还给了幕府。
随后，德川氏亲藩秀忠四男保科正之由出羽最上转封至此，从此藩主家才算是安定下来了。会津可以说是防范奥羽诸多
外样大名的前线，因而亲藩配置于此显得极为重要。此后的会津藩共有九代藩主，多是幕府的栋梁。会津藩作为幕府的柱石，是仅次于越前松平家的大大名。而在幕末时期，藩主
松平容保更是可以说是
悲剧性的藩主，司马辽太郎亦曾有过小说《王城的护卫者》。
建城时间
1384年，芦名直胜建“东黑川馆”
1543年芦名盛氏筑“黑川城”
1592年，浦生氏乡将黑川改名为
若松，全面改筑黑川城。
1593年，天守建立，成为鹤ヶ城，是拥有七层天守的大城。
1611年，会津大地震，城受到严重损害，天守倾斜。
1631年，加藤明成，将七层天守改为五层，增筑西出丸、北出丸。
1868年8月28日，笼城战开始，并于9月22日开城。
1870年开始废城，1874年陆军省下令破坏天守阁。
1965年天守阁重建。
简略资料
石高：
公称二十三万石（
宽政四年的大成武鉴所载是全国第十九大藩，也是东北除
仙台藩以外的第二大藩）因为有南会津御蔵入领总计五万五千石，实际有石高二十八万五千石。
越后：浦原郡
预所：陆奥、越后、下野
大名分类：亲藩，三代藩主政容时代受
赐姓松平，准许使用会津葵
家纹，成为德川一门。
藩主的官位：
从四位下侍从，从四位下左近卫少将，正四位下左近卫中将。末代容保是
正三位参议。与彦根的井伊同格。
军制：幕末长沼流
伺候间：溜间，同室有高松松平家12万石、彦根井伊家35万石。
本邸：和田仓御门内
身份制度
基本上会津武士分成了11个级别，通过
羽织上的纽和襟的颜色可以容易区分出来。
一等至四等，士中阶级，属于上级武士。其纽色依次为：纳户色、黑色、绀色和花色。上级武士可以入藩校日新馆学习，拥有单独谒见藩主的资格。
五等至七等，称为
寄合。其纽色依次为：茶色、萌黄色、浅黄色。其中五等藩士也有独自谒见藩主的资格。
八等到十一等的就是足轻了。纽色依次为：黑色、大和柿、
白鼠、花色。而十一等之下的藩士，是不能选用裃着的。
另：幕末的
新撰组在浪士队最初编成的时候，选用的是浅黄色的羽织其实就是相当于会津藩第十四等（最末等）所使用的颜色。
武艺流派
可以说
会津这样的大藩，其
藩士的武艺流派相当的繁杂，我对剑术
枪术没有什么具体认识，照着资料如实记录：
宝藏院流高田派－枪术：志贺与三兵卫/小太郎/黑河内传五郎/安藤市藏
大内流－枪术：户田安左卫门一吉
一旨流－枪术：内田伴之助
一刀流沟口派－剑术：伊藤政盛
新天流－剑术：千里富次郎忠行
太子流－剑术：中村弥三左卫门尚坚（享保十六年没、中林派）/浦野直胜（宝历八年没、浦野派）/丸山左平治胤往
安光流－剑术：望月新兵卫安胜（享保三年没）
神道精武流－剑术、
柔术：小笠原城之助长政（文化九年江户没）
水野新当流－居合：小林广
右卫门岁程（享保十年没）/小林广右卫门岁重
新阴待舍流－剑术：川纲重教/小川征誉
新天流－剑术：千里富次郎忠行
天流－剑术：广瀬武昭
东军流－剑术：长坂光珍
破东一流－剑术：渡边又助
万流－剑术：町野忠助重胜（天保二年没）
今井景流－居合：明石重贞
大野流－剑术：大野勇助重休（安永六年没）
大桥牧流－剑术：大江贞辰
古天流－剑术：松本勇
神梦想
一刀流－剑术：黑河内传五郎兼规（
明治元年、会津落城时因为感到愤慨而切腹自杀）
心清流－剑术：中林弥三左卫门尚坚（师范）
神梦想真流－剑术：神田右源次良近（享保二十年没）
神梦想气乐流－居合：黑河内百太郎义次
孙子神奇正流－剑术：黑河内传五郎（师范）
大道流－剑术：后藤玉右卫门忠栄（享保十七年没）
天真白井流－剑术：奥村三左卫门光丰
林崎明神流－居合：渡边又助
樊噌流－居合：吉田多文忠顺
梦想无乐流－居合：坂井宇兵卫次长（宝历六年没）
无边流－枪术：上远野保
山野流－试剑（？）：长坂源吾
年号说明：享保，自1716年开始 / 文化，自1804年开始 / 安永，自1772年开始
/ 明治，自1868开始 / 文政，自1818年开始 / 宝历，自1751年开始
会津藩主历史
关原之战以前
会津地区最早属于
常陆国的领地，从七世纪以后被划入成为
陆奥国的领地。到了
战国时代，由于平安时代末期
镰仓时代初期的武将佐原义连在
奥州战争中有功于
源赖朝，被赐予会津郡。
佐原义连原来姓三蒲氏，由于居住在
相模国衣笠城的东南方佐原地区（现在的
神奈川县横须贺市佐原），就以“佐原氏”自称（横须贺市自古为三蒲氏的根据地）。义连除了兼任京都扶持众之外，因为领有会津郡的关系，也就自称“会津守护”。义连本身并没有居住在会津郡，而是后代才移居到此。由于今天的横须贺市自古又称为“芦名”，所以义连的子孙自第三代开始才开始以地名自称为
芦名氏，并以领地作为发展依据，成为
战国大名之一。
原来会津地区有个规模不大的“东黑川馆”，
至德元年（1384年）的时候，芦名氏第七代大名芦名直盛将他扩大维修，兴建一座新的
黑川城。天正17年（1589年）时，由于芦名氏与
伊达政宗争夺会津地区，结果败于
折上原之战，
芦名义广战败，只好弃黑川城逃往
常陆国。然而，在天正18年（1590年）时
丰臣秀吉以“违反惣无事令”为由，以及推行
奥州仕置的政策，没收了政宗在会津一带的领地，也包括黑川城。从此黑川城则交由
蒲生氏乡管理（氏乡俸禄42万石，检地后增至92万石）。氏乡进驻会津后大力扩建黑川城，并且将扩建的黑川城更名为“鹤ヶ城”（“鹤城”的意思），同时从
京都招集商人等，带动会津地区的经济，也将领地的经营建立起不错的成效。
氏乡死后，在
庆长3年（1598年）时，其子蒲生秀行由于年轻，加上氏族中发生骚动而被丰臣秀吉移封到
宇都宫，同时遭到减俸变成18万石的处分。因此会津籓主变成从越后来的
五大老之一
上杉景胜（俸禄达120万石）。不过景胜因为
关原之战的时候参加
石田三成的西军，其后又沉痛打击了东军的
伊达氏与
最上氏，所以在庆长6年（1601年）时被移封到
米泽，俸禄减少到30万石。
蒲生时代
庆长6年（1601年），在关原之战时支持德川方面的蒲生秀行因功受赏再次入封会津（60万石）。不过第二代的蒲生忠乡在
宽永4年（1627年）时不幸
英年早逝，更糟糕的是他无嗣可继承家业，蒲生氏突然要面对改易的问题。忠乡的弟弟蒲生忠知也因为无子嗣（仅有7个女儿）而被幕府易封到伊予国松山藩，俸禄被减为24万石。
加藤时代
宽永4年（1627年），
加藤嘉明由于累积了
文禄之役、关原之战以及大阪夏之阵的战功而入封会津（俸禄40万石）。由于庆长16年8月21日（1611年9月27日）发生了震度高达六级的会津地震，原来的
天守被震垮而倾杞，于是嘉明的儿子加藤明成重新修建，改为今日所见的层塔型天守。尽管明成有魄力，或许有建筑上的天份，但是他也是个相当糟糕的藩主，缺乏凝聚人心的团结力量，结果家臣一致与他闹对立，发生会津骚动，甚至有家臣出走，明成还对出走的家臣进行追杀。于是幕府又裁定明成移封到
石见国吉永藩（今天的
岛根县大田市）隐居，并且老死于当地。
松平时代
会津藩藩厅的若松城
宽永20年（1643年），加藤氏改易，会津籓由
出羽国山形藩，第二代将军秀忠的庶子保科正之以23万石俸禄入封。由于正之是第三代将军家光的同父异母弟，个性忠诚低调，因此受到家光极大的信赖与倚重。正之在世时一直不肯归宗，恢复松平姓氏，因为正之是个忠义的人，保留姓氏以纪念保科氏对他的养育之恩；会津藩一直到第三代藩主正容才归宗为“松平”氏。以后，保科氏的子孙就以会津松平家成为固定的家氏与血脉。松平家门第的
家徽也是采用德川家的圆形三叶葵（“丸に三つ葵”），旗号则是采用繁体汉字“会”字型号。
幕末
最后的藩主的九代容保，是由八代藩主松平容敬的义子，由于容敬是
美浓国高须藩第九代藩主松平义健的亲弟，加上膝下犹虚，所以才会被过继来到会津籓的。
文久2年（1862年），容保成为
京都守护职，将麾下的
新撰组（也是尔后奥州
会津战争的幕府军部队之一）与会津直辖队一起担负了取缔尊攘派志士和京都的治安维持。并且在
禁门之变，击退了打算攻击
孝明天皇的
长州藩阵营。此后容保受到孝明天皇极度的信任并且赐予“御宸翰”（ごしんかん；
日本天皇的亲笔文件）一篇。
在
庆应2年12月（1867年1月30日），孝明天皇不幸驾崩（有一说是遭到暗杀），失去天皇支持的
江户幕府与跟已经签订
萨长同盟的
萨摩藩与长州藩的对立白热化。随着
大政奉还以及
王政复古两次
政治事件之后，
戊辰战争的首战
鸟羽伏见之战爆发了。会津藩很自然地被看作旧幕府势力中心之一，成为了新政府军的仇敌。鸟羽伏见之战后，
明治天皇更加倚赖新政府军。不过会津藩以
奥羽越列藩同盟的方式获得其他籓主人力物力方面的支援，作为抵抗新政府军的条件。不过，在长达一个月的会津若松城的战斗中（
会津战争），会津藩还是败北投降了。
投降之后，会津松平氏在会津藩的领地被明治政府没收了。藩主容保美其名被移封到
鸟取藩，实则遭到软禁。明治2年（1869年），明治政府容许容保的
嫡子容大继续保有氏名，但是不得再居住在若松城中，加上一年前旧领地
猪苗代城已经遭到焚毁，因此藩士们只好选择带着九个月大的容大移居到陆奥国斗南藩安身立命（今
青森县陆奥市）。另一方面，会津地方
废藩置县前，成为了由于明治政府
文官管理政治局的直辖地，此后虽然成为了若松县，不过在明治9年（1876年）被
福岛县合并。
历任藩主
蒲生家
蒲生秀行（1601——1612）
蒲生忠乡（1612 -——1627）
加藤家
加藤明成（1631——1643）
会津松平（保科）家
现代
明治维新后日本政局长期由
长州藩等西部出身者把持，会津藩作为维新时期的
保守派在政治和经济上遭受打压（例如虽然
会津若松是交通要冲，但至今没有
新干线和建造新干线的计划），致使经济落后于周围地区，当地居民对此颇有微词。2011年3月11日
东日本大震灾后
福岛县才被重新重视，为了激励当地居民重建家园2013年的
大河剧改为八重之樱，主角是会津藩出身的
新岛八重。
1986年
若松市拒绝了由原长州藩现
山口县的
萩市为纪念
戊辰战争120周年提出的建立
友好城市的申请，理由是还没过120年。