家蚕基因组计划

由西南农业大学与北京基因组研究所共同紧密合作，以应对国际竞争严峻局面，实施家蚕基因组计划

家蚕基因组计划是指由西南农业大学与北京基因组研究所共同紧密合作，以应对国际竞争严峻局面，实施家蚕基因组计划。该计划实施于人类基因组计划完成之际，面对国际竞争，实现了家蚕领域基因组测序的零的突破，使中国的家蚕研究走在了世界的前沿。

主要影响

2004年西南农业大学（现西南大学）在世界上率先绘制完成了家蚕基因组框架图，其研究成果发表于Science，建立了世界上最大的家蚕表达序列标签数据库，发现了与家蚕性别决定、发育和变态、激素调节以及抗性等密切相关的关键功能基因群，并且在家蚕基因组结构特征、基因的组织、进化和比较基因组学方面也获得了一批具有重要价值的理论成果，在国内外产生了广泛的影响。获2003年度中国高校十大科技进展1项，以及建国六十年重庆入选的科技成果。温家宝总理指出：在人类基因组、植物基因组、微生物基因组和家蚕基因组测序等重要前沿领域，我国科学家做出了卓越贡献。

大事记

西南大学蚕学与系统生物学研究所

家蚕基因组计划大事记

1995年9月，向仲怀院士和中国科技大学李振刚教授提出家蚕基因组计划设想,并着手基因组生物材料系统的构建。同年日本开始实施家蚕基因组研究。

1995年9月，西南农业大学开始构建家蚕近等位基因系统。

2000年10月，夏庆友博士奉召从日本九州大学回国筹备家蚕基因组工作。夏庆友教授、鲁成教授先后考察北京华大基因组研究所、中国人类基因组北方中心和南方中心等平台单位。

2000年10月，中国蚕学会学术年会在西安召开，理事长向仲怀院士作《基因组生物学的发展与家蚕基因组计划》的报告。

2000年11月，北京华大基因组研究所所长杨焕明教授应向仲怀院士、鲁成教授邀请访问西南农业大学蚕桑学重点实验室。

2000年12月8日，由向仲怀、杨焕明、夏庆友、周泽扬、鲁成署名，以西南农业大学、华大基因的名义联合提出：《21世纪中国的现代丝绸之路——“关于推动中国家蚕基因组计划”的项目建议书》，并报送科技部基础研究司、科技部农村与社会发展司、国家经贸委投资与规划司、国家经贸委技术与装备司、农业部科技教育司、农业部发展计划司、国家自然科学基金委生命科学部、中国科学院生物局、中国工程院农业轻纺与环境工程学部、中国工程院产业工程科技委员会等部门。

2001年1月，夏庆友教授赴日本短期访问，推进中日家蚕基因组研究的交流与合作。5月，夏庆友回校，西南农业大学专项资助启动“中国家蚕基因组前期研究”。

2001年6月，重庆市科委院士基金专项资助启动“家蚕EST计划”。

2001年8月，国际鳞翅目昆虫基因组计划筹备会议在法国里昂召开（未邀请中国参加），家蚕基因组国际合作组织开始启动。

2001年12月，日本蚕丝昆虫研究所田村俊树博士访问西南农大，传递法国里昂国际鳞翅目昆虫基因组计划筹备会议信息。

2001年12月，日本九州大学藤井博教授来访，推进中日家蚕遗传材料的共同保存与合作研究。

2001年12月，农业部资助启动蚕桑学重点实验室建设项目。

2002年1月4日，新华社记者采访夏庆友教授，并发表内参《开展家蚕基因组研究具有重要价值》。

2002年2月，《江苏蚕业》2002年1期特约发表向仲怀院士《21世纪的丝绸之路》一文。

2002年3月4日，第一次全国家蚕基因组研讨会议在上海召开。

2002年3月，重庆市副市长陈光国主持召开农业部重点实验室建设项目协调会，落实配套经费。

2002年3月，西南农业大学与中国农科院蚕研所、苏州大学和浙江大学等单位在西南农业大学商讨关于联合开展家蚕基因组研究的可行性。

2002年4月23日，向仲怀院士、夏庆友教授访问中国科学院北京基因组研究所。

2002年4月24日，第二次全国家蚕基因组研讨会在江苏召开。

2002年7月19日，第三次全国家蚕基因组研讨会议在上海召开。向仲怀院士访问上海国家人类基因组南方中心。西南农业大学启动家蚕大规模EST测序计划。

2002年8月16日，日本家蚕基因组研究小组成员三田英和和岛田透来访，了解中国家蚕基因组的开展情况。

2002年9月，西南农业大学完成家蚕10万条EST测序及生物学分析。

2002年9月30日，国际鳞翅目昆虫基因组计划正式会议在日本筑波召开，正式确定将完成家蚕基因组计划作为该组织第一目标。中国加入该组织。周泽扬教授、夏庆友教授应邀代表西南农业大学蚕桑学重点实验室出席会议，夏庆友教授做大会发言，报告中国EST研究结果。

2002年9月30日夜,应日方建议，周泽扬、夏庆友与日本家蚕基因组成员连夜举行会谈，商讨日中合作完成家蚕全基因组框架图等事宜。经过激烈讨论，双方达成原则意见，以各自占50%的比例共同完成5X家蚕全基因组框架图。

2002年11月，《蚕业科学》2002年第四期发表向仲怀院士《国际鳞翅目昆虫基因组筑波会议与中国家蚕基因组》一文。

2002年11月11日，日本家蚕基因组研究小组成员三田英和和岛田透来访，再次确认日中家蚕基因组研究合作事宜。

2002年11月17日，中国水稻基因组框架图完成。向仲怀院士联合卢良恕、石元春、方智远、郭予元等院士发表关于建议紧急启动中国家蚕基因组计划的《院士建议》，引起广泛关注。

2002年12月10日，西南农业大学分别向财政部教科文司、科学技术部工程技术中心、国家自然科学基金委、国家外经贸委茧丝办提交《关于申请资助启动中国家蚕功能基因组研究的紧急请示》。

2002年12月29日，向仲怀院士辞去西南农业大学校长职务。

2003年1月19日，鳞翅目昆虫基因组加拿大多伦多会议召开。夏庆友教授、周泽扬教授应邀出席会议。

2003年2月16日，教育部周济部长视察西南农业大学蚕桑学重点实验室。

2003年3月5日，日本单方面启动并独家实施家蚕全基因组计划。

2003年4月,日本召开2003年度昆虫产业创新论坛，并提出集中全日本优势，以家蚕基因组计划开创“由日本出发的丝绸之路”，将2003年命名为日本丝绸之路元年。

2003年4月,向仲怀院士访问日本，敦促实现中日合作实施家蚕基因组计划。

2003年5月,日本基因组研究核心成员在九州大学召开专门会议，就是否与中国合作进行了激烈辩论。随后，日方终止了与中方的合作与联络。

2003年5月18日,向仲怀、周泽扬、鲁成、夏庆友、吴大洋等在西南农业大学蚕桑学重点实验室彻夜讨论，毅然决定：维护国家利益，回应国际竞争，克服一切困难，全力拼搏，启动中国家蚕基因组计划。

2003年5月22日，西南农业大学召集职能部门负责人讨论会，决定成立西南农业大学“中国家蚕基因组计划”项目协调小组。27日，项目协调小组正式成立。

2003年5月25日，SARS期间，西南农业大学与北京基因组研究所代表在重庆紧急会谈，确定紧密合作，应对国际竞争严峻局面，立即全面实施家蚕基因组计划。

2003年5月29日，西南农业大学蚕桑学重点实验室全体动员，全面投入家蚕基因组计划攻关，深夜突击提取基因组测序用DNA材料。

2003年6月9日，第一个用于WGS测序的家蚕全基因组文库出炉。西南农业大学蚕桑学重点实验室为赴京攻关组壮行。

2003年6月11日，夏庆友教授率领攻关组进驻中科院北京基因组研究所。15日，夏庆友教授任家蚕基因组测序平台总指挥。

2003年6月23日，测序平台完成数十项技术改革，并克服重重困难使家蚕基因组测序进入稳定产出期。

2003年7月22日，完成总测序任务的五分之二。日夜拼搏，过度疲劳使测序前线专家和工作人员大批病倒。西南农业大学党委书记华鹏、向仲怀院士赴京看望攻关组成员。

2003年8月11日，完成总测序任务的五分之四。测序平台达到运转极限，信息平台全面投入分析。重庆市科委张文副主任等领导亲临测序前线视察。

2003年8月27日，完成家蚕全基因组6X测序，共计550万个反应。家蚕基因组计划进入序列总组装阶段。

2003年9月15日，重庆市常务副市长黄奇帆视察蚕桑学重点实验室。

2003年10月8日，重庆市科委周旭主任到蚕桑学重点实验室调研。完成家蚕全基因组6X序列组装。西南农业大学北京攻关组陆续返回实验室，并立即着手生物学分析和重要功能基因研究。

2003年10月16日，重庆市科委周旭主任、张文副主任、农村处刘剑飞处长、办公室刘小川主任及西南农业大学常务副校长周泽扬前往北京，向科技部、中国科学院、自然科学基金委等部委汇报家蚕基因组完成情况。重庆市科委牵头筹划新闻发布会。

2003年10月24日，国家自然科学基金委下达重点项目“家蚕性别调控分子机制和应用基础研究”。

2003年11月11日，国务委员陈至立对家蚕基因组框架图绘制完成作重要批示。

2003年11月13日，中国科学院北京基因组研究所杨焕明、汪建、于军、王俊等来渝参加新闻发布会，并讨论基因组研究论文写作方案。

2003年11月15日，重庆市人民政府和中国科学院联合在重庆召开新闻发布，向世界宣布家蚕基因组框架图绘制完成。中国科学院、科技部、教育部、农业部领导到会祝贺。

2003年11月15日，国务委员陈至立、重庆市市长王鸿举及中国科学院、科技部、教育部、农业部领导到蚕桑学重点实验室视察，并听取了家蚕基因组研究汇报。

2003年11月15日，西南农业大学中国科学院北京基因组研究所应用基因组研究联合实验室成立，国务委员陈至立和重庆市市长王鸿举为实验室揭牌。

2003年12月16日，日本吉川宽教授率日本家蚕基因组代表团来渝访问，通报日本完成家蚕基因组3X测序，恳求恢复与中国合作。

2004年1月4日，国际鳞翅目昆虫基因组计划协调人、美国罗得岛大学M.R.Goldsmith教授来蚕桑学重点实验室交流访问。

2004年3月29日，向仲怀院士、夏庆友教授应日本蚕丝学会理事长小林正彦教授邀请参加日本第74届蚕丝学大会。向仲怀院士作“加强中日合作共建21世纪丝绸之路”的大会报告，夏庆友教授向大会作中国家蚕基因组研究进展的报告。

2004年4月5日，重庆市副市长吴家农主持召开协调会，决定由重庆市财政局、重庆市科委、重庆市教委、重庆市农委对蚕桑学重点实验室给予重点支持。家蚕基因组和功能基因组应用研究平台建设全面启动。

2004年4月6日，科技部科技司贾敬敦副司长等一行四人专程到蚕桑学重点实验室考察。同年9月科技部下达“863”重点项目—家蚕遗传资源的分子评价和重要功能基因研究。家蚕基因组计划进入功能基因研究和应用阶段。

2004年5月28日，中国科学院北京基因组研究所正式成立揭牌。全国人民代表大会副委员长、中国科学院院长路甬祥在揭牌仪式上发言高度赞扬中国家蚕基因组计划所取得的成绩。

2004年6月29日，科技部程津培副部长等来渝视察蚕桑学重点实验室。

2004年7月，第四次全国家蚕基因组计划研讨会在重庆召开。全国家蚕基因组研究协作网初步形成。

2004年7月1日，经过数十次修改完善，“中国家蚕基因组框架图”研究论文定稿，正式提交《SCIENCE》。

2004年9月21日，第五届中国国际丝绸会议在苏州召开，向仲怀院士作“家蚕基因组计划与21世纪丝绸之路”大会专题报告。

2004年9月23日-10月1日，2004年中国西南农业大学—日本九州大学双边学术交流会在西南农业大学召开，藤井博教授一行9人与会。

2004年11月，中国家蚕基因组计划完成基因的注释和功能的初步分析,并在国际权威基因数据库美国国家生物技术信息中心（NCBI）上公布数据。

2004年11月6日，中国蚕学会第四届青年学术交流会在广州召开，蚕桑学重点实验室10人出席，并通过2个大会特邀报告和8个专题报告全面介绍了家蚕基因组和功能基因组研究成果。

2004年11月11日，中国昆虫学会成立60周年纪念暨学术年会在重庆召开，向仲怀院士作“家蚕基因组”大会特邀报告。

2004年11月19日，国际家蚕基因组与资源学术讨论会在杭州召开，夏庆友教授应邀作“中国家蚕基因组和功能基因组研究”大会报告。

2004年12月8日,重庆市委书记黄镇东、副书记邢元敏、常委范照兵、副市长吴家农一行到蚕桑学重点实验室视察调研。

2004年12月10日，由中国独立完成的家蚕6X基因组序列和生物学分析研究结果在《SCIENCE》上发表，标志家蚕基因组计划第一阶段目标胜利完成并进入新的阶段。

2008年完成40个基因组重测序揭示家蚕驯化发表于《SCIENCE》

重要论文

A draft sequence for the genome of the domesticated silkworm (Bombyx mori),Science 10 December 2004:

Vol. 306 no. 5703 pp. 1937-1940

Complete resequencing of 40 genomes reveals domestication events and genes in silkworm (Bombyx),Science 16 October 2009: Vol. 326 no. 5951 pp. 433-436

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